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Reconhecemos as comunidades de bactérias como componentes integrais e funcionalmente importantes de diversos habitats, desde colectivos do solo até ao microbioma humano. Para funcionarem como comunidades produtivas, as bactérias coordenam várias interações, exigindo frequentemente mudanças no crescimento e desenvolvimento. . Estas interações ocorrem a vários níveis, incluindo o contacto físico, o intercâmbio metabólico, a comunicação mediada por moléculas de pequenos sinais e o intercâmbio de material genético. Este elevado nível de interação interespécies beneficia o microrganismo ao proporcionar uma gama mais vasta de habitats, um metabolismo eficaz, aumentando a resistência à defesa do hospedeiro e reforçando a sua virulência. Isto tem geralmente um efeito prejudicial no hospedeiro e é atribuído a muitas infecções crónicas, o que constitui um desafio terapêutico.
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